Creación del primer biorrepositorio nacional de bacterias multirresistentes disponible para el estudio de la resistencia bacteriana en Chile

La disponibilidad de cepas bacteriana para el estudio de la resistencia bacteriana es clave para los avances en la investigación básica y clínica respecto del tema. Existen pocos biorrepositorios o bancos de bacterias con mecanismos de resistencia conocidos, aisladas de infecciones clínicamente significativas. Una revisión de la literatura revela que sólo en los Estados Unidos de América existe un biobanco de aislados resistentes disponibles para estudios. En esta publicación se cuenta cómo se creó el primer biorrepositorio de bacterias resistentes en Chile asociados a la Red de Laboratorios MICROB-R, con la participación de 11 centros distribuidos a lo largo del país, que a la fecha cuenta con más de 3.500 aislados bacterianos estudiados fenotípica y genotípicamente, disponibles para la comunidad científica chilena.

The availability of bacterial strains for the study of bacterial resistance is key to advances in basic and clinical research. There are few biobanks of bacteria with known resistance mechanisms, isolated from clinically significant infections. A review of the literature reveals that only in the United States of America is there a biobank of resistant isolates. This publication shows the creation of the first biorepository of resistant bacteria Chile associated with the MICROB-R Laboratory Network, with the participation of 11 centers distributed throughout the country, which to date has more than 3,500 bacterial isolates studied phenotypically and genotypically, available to the Chilean scientific community.

Detección de serinocarbapenemasas de clase A y otros mecanismos de resistencia enzimática a β-lactámicos en cepas de enterobacterias con susceptibilidad disminuida a carbapenémicos, aisladas de pacientes de un hospital universitario de Santiago, Chile / Detection of serinocarbapenemases Class A and other mechanisms of enzymatic resistance to β-lactams in enterobacteria strains with diminished susceptibility to carbapenems isolated of patients in a university hospital

Background: The emergence of carbapenemase mediated resistance in Enterobacteriaceae has a strong clinical impact. This study aimed to do a genotypic and phenotypic characterization of the enzymatic resistance to β-lactams in clinical Enterobacteriaceae isolates with decreased susceptibility to carbapenems in a university medical center in Santiago. Methods: During April-September 2010 at Hospital Clinico Universidad de Chile, 23 isolates of carbapenem non susceptible Enterobacteriaceae were collected. We used PCR for the detection of class A carbapenemases (SME, IMI, NMC, GES and KPC) and the modified Hodge with the boronic acid test to phenotypically assess the presence of serine-carbapenemases. To assess extended spectrum β-lactamases (ESBLs) the CLSI phenotypic tests were performed. Metallo-β-lactamases (MBL) and AmpC were assessed with commercial tablets. Results: 18/23 were Klebsiellapneumoniae and 5/23 strains were Enterobacter cloacae. All PCR to class A carbapenemases were negative. 3/23 strains (all E. cloacae), were positive to the Hodge modified test and 1/23, a K.pneumoniae, was positive to the boronic acid test. ESBLs were detected in 14/23 os the strains and AmpC in 5/23. No MBL was detected. Conclusion: No class A serine-carbapenemasa was detected. The decreased susceptibility to carbapenems is probably explained by the β-lactamase activity and due to porin loss.

Introducción: La emergencia de resistencia a β-lactámicos por carbapenemasas en enterobacterias tiene gran importancia clínica. El objetivo de este estudio fue caracterizar genotípica y fenotípicamente la resistencia enzimática a β-lactámicos en enterobacterias con susceptibilidad disminuida a carbapenémicos, en cepas aisladas de pacientes de un hospital universitario de Santiago. Metodología: Durante abril-septiembre 2010, en el Hospital Clínico de la Universidad de Chile se recolectaron 23 aislados. Se detectaron serinocarbapenemasas clase A (SME, IMI, NMC, GES y KPC) mediante RPC. Se empleó el test de Hodge modificado y acido fenil-borónico (APB) para la detección fenotípica de serinocarbapenemasas. Se detectó la presencia de β-lactamasas de espectro extendido según CLSI y AmpC y MBL mediante tabletas comerciales. Resultados: 18 cepas (78,26%) correspondieron a Klebsiella pneumoniae y 5 cepas (21,74%) a Enterobacter cloacae. Todas las RPC para serinocarbapenemasas fueron negativas, en tanto, el test de Hodge fue positivo para 3/23 cepas, todas E. cloacae. Una cepa de K. pneumoniae fue positiva para APB. Se detectó BLEE en 14/23 cepas, AmpC en 5/23 cepas y no se detectó MBL. Conclusiones: En las cepas estudiadas no se detectaron serinocarbapenemasas clase A. Probablemente los mecanismos que explican la susceptibilidad disminuida a carbapenémicos, involucran resistencia enzimática, combinados con cambios en la permeabilidad de la membrana bacteriana.